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国自然永恒的热点信号通路如何快速选择

作者:上海华盈生物医药科技有限公司 暂无发布时间 (访问量:160)

相信不少同学有同样的困惑,信号通路如何快速选择呢?

Let’s 分析

基础版

方法一:根据已知表型,查阅文献及数据库,从中筛选出与之关联的信号通路,将其列为候选对象。(缺点:文献中的差异,在自己实验中很可能没有变化)

方法二:针对已知表型,对样本进行转录组或蛋白组检测,再借助富集分析手段,以此确定候选信号通路。(缺点:RNA和蛋白表达的变化和信号通路的磷酸化变化不搭噶)

方法三:当表型尚不明确时,对样本进行磷酸化蛋白组检测,随后通过激酶底物预测分析,明确表型信息及对应的信号通路。(缺点:杂的信息实在太多了,而分析结果总是围绕经典的几个激酶)

高阶版

信号通路研究主要是针对磷酸化变化进行研究,基础版方法最大的问题就是无法直达痛点,尤其面对多条信号通路的时候,很可能左右为难,束手无策。

高阶选手如何快速选择信号通路呢?

那就不得不提磷酸化抗体芯片啦!

信号通路磷酸化广谱筛选抗体芯片(PEX100):采用三维高分子膜专用技术,在片基上高密度结合  1318  种高特异抗体,分别检测432个信号蛋白的679个磷酸化位点。这些信号蛋白广泛参与多条重要信号通路信号传导过程。芯片针对每一个特定蛋白磷酸化位点,设置一对抗体分别检测其磷酸化(Phospho)和非磷酸化(non-Phospho)状态以提高磷酸化检测灵敏度和稳定性。一次芯片实验即可实现30多条信号通路的同步筛选和具体调变位点的清晰定位。

抗体芯片特点

●   芯片规格为76 x 25 x 1 mm;

●   实现31条信号通路全面筛选;

●   每种抗体设置2次技术重复;

●   适用于组织、细胞等多类型样本;

●   5 x106细胞、100μg总蛋白量即可满足实验;

●   每个检测位点设有磷酸化和非磷酸化配对抗体;

●   可通用于人、小鼠、大鼠等多类型模式生物检测。

抗体芯片原理

Let’s 案例展示

PEX100芯片协助发现抵抗STING(干扰素基因刺激蛋白)激动剂疗法的分子机制

该研究者借助华盈生物提供的PEX100信号通路磷酸化抗体芯片技术服务,系统解析了TLR2激活对STING下游JAK-STAT和NF-κB通路磷酸化水平的调控,为机制阐释提供了关键证据。这一发现为克服STING激动剂治疗抵抗提供了新思路,具有重要的转化价值。

忽然发现,国内大牛发的高分文章都在用PEX100信号通路磷酸化抗体芯片上文献:

1. Song H, Chen L, Pan X, et al. Targeting tumor monocyte-intrinsic PD-L1 by rewiring STING signaling and enhancing STING agonist therapy. Cancer Cell. 2025;43(3):503-518.e10.(复旦大学附属华山医院 细胞)IF=44.5

2. Wang Y, Wang Z, Dong C, et al. Initial cardioplegic flush with crystalloid cardioplegia improves donor heart preservation and function via NR4A3 upregulation and metabolic reprogramming. Sci Bull (Beijing). 2025;70(10):1673-1690.(华中科技大学附属同济医院 心肌组织)IF=21.1

3. Fang Z, Zhao G, Zhao S, et al. GTF2H4 regulates partial EndMT via NF-κB activation through NCOA3 phosphorylation in ischemic diseases. Innovation (Camb). 2024; 5(2):100565.(复旦大学附属中山医院 细胞)IF=25.7

4. Sun Z, Zhou Y, Li L, et al. Inhibiting redox-mediated endothelial migration by gadofullerenes for inducing tumor vascular normalization and improving chemotherapy. Sci Bull (Beijing). 2023; S2095-9273(23)00414-0.(中科院分子纳米结构与纳米技术重点实验室 肿瘤组织)IF=21.1

5. Fu L, Li P, Zhu J, et al. Tetrahedral framework nucleic acids promote the biological functions and related mechanism of synovium-derived mesenchymal stem cells and show improved articular cartilage regeneration activity in situ. Bioact Mater. 2021; 9:411-427.(南开大学医学院 细胞)IF=20.3

6. Long H, Yu W, Yu S, et al. Progesterone affects clinic oocyte yields by coordinating with follicle stimulating hormone via PI3K/AKT and MAPK pathways. J Adv Res, 2021; 33: 189-199.(上海交通大学第九人民医院 细胞)IF=13.0

7. He D, Wu HG, Xiang JN, et al. Gut stem cell aging is driven by mTORC1 via a p38 MAPK-p53 pathway. Nat Commun. 2020; 11(1):37.(华中科技大学附属同济医院 小肠组织)IF=15.7

8. Yin LM, Xu YD, Peng LL, et al. Transgelin-2 as a therapeutic target for asthmatic pulmonary resistance. Sci Transl Med. 2018; 10(427):eaam8604.(上海中医药大学附属岳阳医院 细胞)IF=14.6

9. Jiang HL, Sun HF, Gao SP, et al. SSBP1 uppresses TGF-β-Driven Epithelial-to-Mesenchymal Transition and Metastasis in Triple-Negative Breast Cancer by Regulating Mitochondrial Retrograde Signaling, Cancer Res. 2016; 76(4):952-64.(复旦大学附属肿瘤医院 肿瘤组织)IF=16.6

10. Jia DS, Jing Y, Zhang ZF, et al. Amplification of MPZL1/PZR promotes tumor cell migration through Src-mediated phosphorylation of cortactin in hepatocellular carcinoma. Cell Res. 2014; 24(2):204.(复旦大学附属肿瘤医院 肿瘤组织)IF=25.9

 

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